张鲁嘉课题组

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引用：

Zhang,C,Feng,Y,Zhu,Y,Gong,L,Wei, H,Zhang,L. NAC4ED: Ahigh-throughput computational platform for the rational design of enzymeactivity and substrate selectivity.mLife.2024: 3:505-514.

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ETSS:基于酶表面电荷优化策略进行高通量酶诱变计算，分析E能量值

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ETSS根据酶表面电荷优化策略，通过计算单个氨基酸对整个蛋白质结构的贡献，分析突变前后的Ei能值，以确定突变位点是否增强了蛋白质的热稳定性。

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NAC4ED:基于酶催化底物的“近攻击构象”设计策略进行高通量酶诱变计算，从而精准指导天然酶的设计改造

NAC4ED通过对催化反应物理化学基础的精准分析，识别控制反应性能的活性构象，构建定量核心模型来控制特定性能，并结合催化距离或自由能进行合理设计，从而快速筛选出符合特定功能要求的酶突变体。在酶设计过程中筛选突变的适应性景观，并基于近攻击模型将复杂的催化过程精简为参数。包括蛋白质模型构建、复合结构获取、分子动力学模拟和活性构象分析。

沪ICP备20010484号-1