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引用：
Chuanxi Zhang, Yinghui Feng, Yiting Zhu, Lei Gong, Hao Wei,
ETSS：AI驱动蛋白质热稳定性设计平台
引用：
ETSS基于酶表面电荷与结构稳定性优化策略，通过高通量诱变计算量化单氨基酸对整个蛋白质的结构与能量贡献，分析突变前后的Ei能值，以筛选可增强蛋白质热稳定性的关键位点组合。
NAC4ED：基于近进攻态的酶活性AI设计平台
NAC4ED通过对催化反应物理化学基础的精准分析，识别控制反应性能的活性构象，构建定量核心模型来控制特定性能，并结合催化距离或自由能进行合理设计，从而快速筛选出符合特定功能要求的酶突变体。在酶设计过程中筛选突变的适应性景观，并基于近攻击模型将复杂的催化过程精简为参数。包括蛋白质模型构建、复合结构获取、分子动力学模拟和活性构象分析。
HelixWings：高效利用低廉非天然辅因子的AI驱动酶工程化改造平台
HelixWings平台通过将人工智能加速的动态构象信息捕获与静态微环境设计相结合，大幅降低了所需的筛选规模及计算设计所需时间，较之精确的理性设计技术时间消耗降低了23倍，较之相对盲目的定向进化效率和精度更大幅提升，有效展示了结合AI引导与理性设计结合的集成的优势
引用：
ESDS
CASTP
引用：
引用：
, Xiaomang Tang, Dongbing Cui, Zhiqiang Yao, Bei Gao, Shuiqin Jiang, Bo Yin, Y. Adam Yuan*, Dongzhi
Lujia Zhang
Wei*. A method to rationally increase protein stability based on the charge-charge interaction, with application to lipase LipK107.
Protein science
. 2014, 23: 110-116
Lujia Zhang*
. NAC4ED: A High-Throughput
Computational Platform for the Rational Design of Enzyme Activity and Substrate Selectivity.
Mlife
. 2024, 1–10
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